Comprobación limitada de Hacienda: sus derechos y cómo defenderse

Abrir la sede electrónica y encontrarse con una notificación de la Agencia Tributaria es una de las situaciones que más inquietan a autónomos y pymes. Conviene, sin embargo, hacer una distinción que cambia por completo la forma de afrontarla: la inmensa mayoría de esas cartas no son inspecciones, sino comprobaciones limitadas. Y en una comprobación limitada de Hacienda usted tiene derechos concretos, la Administración tiene límites muy claros y el reloj corre a su favor. Conocer esas reglas es, en muchos casos, la diferencia entre cerrar el expediente sin coste y terminar con una liquidación y una sanción.

Qué es una comprobación limitada de Hacienda

La comprobación limitada es un procedimiento de gestión tributaria regulado en los artículos 136 a 140 de la Ley 58/2003, General Tributaria (LGT). Lo tramitan los órganos de Gestión —no los de Inspección— y su finalidad es contrastar lo que usted declaró con la información que ya obra en poder de la Administración: datos de terceros, modelos informativos, facturación declarada, retenciones practicadas, etc.

Los supuestos que vemos con más frecuencia en el despacho son:

• Discrepancias entre el modelo 303 trimestral y el resumen anual, o entre el IVA declarado y el imputado por clientes y proveedores.
• Gastos deducidos en el IRPF del autónomo cuya afectación a la actividad la AEAT pone en duda (vehículo, suministros del domicilio, dietas).
• Rendimientos del alquiler y aplicación de la reducción por arrendamiento de vivienda.
• Deducciones autonómicas de la Comunidad Valenciana aplicadas sin acreditar los requisitos.
• Diferencias entre las retenciones declaradas en el modelo 111 y las imputadas por los perceptores.

A diferencia de una inspección, el alcance es más estrecho y los medios de comprobación están tasados. Pero conviene no bajar la guardia: de una comprobación limitada puede salir perfectamente una liquidación con intereses y un expediente sancionador.

Hasta dónde puede llegar Hacienda: los límites del artículo 136 LGT

Lo que sí puede hacer

• Examinar sus declaraciones, autoliquidaciones y los datos que ya constan en poder de la Administración.
• Revisar los registros y documentos exigidos por la normativa tributaria: libros registro de IVA, facturas emitidas y recibidas, justificantes de gasto.
• Requerirle a usted la aportación de esa documentación y solicitar aclaraciones sobre los datos declarados.
• Pedir información a terceros sobre operaciones concretas, cuando esa información deba figurar en declaraciones informativas.

Lo que no puede hacer

• Examinar la contabilidad mercantil. Es el límite más importante y el más ignorado. Solo puede revisarla si usted la aporta voluntariamente, y únicamente para constatar la coincidencia entre lo contabilizado y los datos comprobados.
• Requerir a entidades financieras información sobre movimientos de cuentas. Eso queda reservado al procedimiento de inspección.
• Actuar, con carácter general, fuera de sus propias oficinas, salvo los supuestos tasados que prevé la norma.
• Ampliar el alcance del procedimiento sin comunicárselo previamente. La jurisprudencia reciente ha sido rotunda: la ampliación debe notificarse antes de la apertura del trámite de alegaciones —no de forma simultánea ni posterior—, en garantía de los derechos reconocidos en los artículos 34.1.ñ) y 137 LGT.

Detectar que la Administración ha traspasado alguno de estos límites es, con frecuencia, el argumento que anula la liquidación. Por eso conviene revisar el expediente con criterio técnico y no limitarse a mandar los papeles que le piden. En nuestra área de defensa frente a la AEAT ese análisis es siempre el primer paso.

Sus derechos durante el procedimiento

La comunicación de inicio no es un mero trámite: debe expresar la naturaleza y el alcance de las actuaciones e informarle de sus derechos y obligaciones. A partir de ahí, usted puede:

• Saber en todo momento el estado de tramitación del expediente.
• No aportar documentos que ya presentó o que ya obran en poder de la Administración.
• Recibir una propuesta de liquidación motivada, con los hechos y fundamentos en los que se apoya.
• Disponer de un trámite de alegaciones antes de que se dicte la liquidación.
• Que la resolución que ponga fin al procedimiento esté igualmente motivada.
• Recurrir la liquidación en reposición o en vía económico-administrativa.

El plazo de seis meses y la caducidad

Este es el punto que más partidas se gana. La comprobación limitada tiene una duración máxima de seis meses, por aplicación del artículo 104.1 LGT. El plazo se cuenta desde la notificación del inicio hasta el primer intento válido de notificación de la resolución.

Si se superan esos seis meses sin resolución, el procedimiento caduca. Y la caducidad tiene dos consecuencias de enorme valor práctico:

• Las actuaciones realizadas en el procedimiento caducado no interrumpen el plazo de prescripción de cuatro años. En expedientes de ejercicios antiguos, esto puede dejar la deuda prescrita.
• La Administración debe declarar expresamente la caducidad antes de iniciar un nuevo procedimiento sobre el mismo objeto, incluida una inspección. Iniciar el segundo procedimiento sin ese pronunciamiento previo vicia lo actuado.

Por eso lo primero que anotamos al recibir un expediente es la fecha exacta de notificación del inicio. Es un dato que decide casos.

El efecto preclusivo: por qué un expediente cerrado le protege

El artículo 140 LGT establece que, dictada la resolución de una comprobación limitada, la Administración no puede volver a regularizar el mismo objeto y período salvo que descubra hechos o circunstancias nuevas que resulten de actuaciones distintas de las realizadas.

Los tribunales han reforzado este criterio en los últimos años: si la AEAT ya disponía de toda la información necesaria y no aparecen hechos nuevos, no puede iniciar después una inspección sobre los mismos elementos. El efecto preclusivo alcanza tanto a los elementos sobre los que hubo pronunciamiento expreso como a los que, habiendo sido comprobados, no se regularizaron. Guardar la resolución de una comprobación antigua puede ser, años después, su mejor defensa.

Cómo defenderse, paso a paso

1. Anote la fecha de notificación y calcule el vencimiento de los seis meses.
2. Lea el alcance con detalle: qué impuesto, qué ejercicio y qué conceptos concretos se comprueban. Todo lo que quede fuera no puede ser regularizado sin ampliación notificada.
3. Aporte lo que se le pide, y nada más. Entregar la contabilidad mercantil sin necesidad amplía voluntariamente las facultades de la Administración.
4. Reúna los justificantes: facturas completas, medios de pago, contratos y cualquier prueba de la afectación real a la actividad.
5. Presente alegaciones siempre, y en plazo. Es el momento de introducir los argumentos y la prueba que luego sostendrán el recurso.
6. Revise la motivación de la propuesta y de la liquidación. Una motivación genérica o que no responda a sus alegaciones es un motivo de impugnación.
7. Si llega la liquidación, dispone de un mes para recurso de reposición o reclamación ante el TEAR. Valore también la suspensión de la deuda.
8. Trate la sanción como un expediente aparte. Requiere culpabilidad probada y motivada: la simple discrepancia de criterio o una interpretación razonable de la norma no bastan para sancionar.

Conclusión: responder bien la primera carta ahorra el recurso

Una comprobación limitada no es una inspección, pero tampoco es un trámite inocuo. La mayoría de los expedientes que llegan al despacho en fase de recurso se complicaron en el primer paso: se aportó documentación de más, se dejó pasar el trámite de alegaciones o no se revisó si Hacienda se había excedido en su alcance. La recomendación práctica es sencilla: antes de contestar, dedique una hora a analizar el alcance, el plazo y los límites del procedimiento. Y si el importe en juego lo justifica, hágalo acompañado.

Si necesita revisar una notificación o preparar sus alegaciones, puede escribirnos a través de nuestra página de contacto o consultar el resto de servicios de asesoría fiscal del despacho.

¿Necesita ayuda con una comprobación limitada de Hacienda? En Santamaría Baeza (Avda. Aguilera 39, Entlo. B, Alicante) le asesoramos con presupuesto cerrado y primera consulta gratuita. 📞 654 58 14 93 (también WhatsApp) · asesoria@santamariaabogados.es